Indikátory horizontálního přenosu ARG

Prvek & vázané ARG

Přesný název & molekulární funkce 

Šíření v prostředí (One Health)

Klinické riziko pro lidské zdraví 

IS1133, IS1247_1, IS1247_2 

Typicky vázané ARG: 

blaCTX-M (ESBL) 
mph(A) (makrolidy) 
aac(6')-Ib (aminoglykosidy) 

Inzerční sekvence (IS) 

Nejprostší mobilní elementy. Vytvářejí složené transposony a obsahují promotory, které výrazně zvyšují expresi (přepis) vázaných genů rezistence. 

Čistírny odpadních vod (ČOV), hnojiva, půda 

IS prvky se masivně akumulují v odpadních vodách z nemocnic a zemědělství. Slouží jako "lepidlo", které v životním prostředí spájí původně neškodné geny z půdních bakterií s patogeny.

Komplikace léčby širokospektrými antibiotiky 

Vysoká exprese genů jako blaCTX-M zprostředkovaná IS elementy způsobuje selhání léčby cefalosporiny 3. generace u komunitních i nemocničních infekcí (např. těžké močové infekce či sepse způsobené E. coli). 

tnpA_3 

Typicky vázané ARG: 

blaNDM, blaKPC (karbapenemázy) 
mcr (polymyxiny/kolistin) 
tet(X) (tigecyklin)

Gen pro transposázu 

Kóduje enzym zajišťující přeskok (transpozici) sekvencí. Funguje nezávisle na hostiteli (recA-independent), což umožňuje přenos mezi zcela nepříbuznými kmeny.

Velkochovy zvířat, akvakultura, říční sedimenty 

Transposáza tnpA umožňuje přeskakování genů rezistence z genomu půdních/zvířecích bakterií na konjugativní plazmidy, které se následně snáze šíří vodními toky a potravním řetězcem.

Přenos rezistence vůči antibiotikům "poslední záchrany" 

Zprostředkovává rychlý přenos rezistencí vůči karbapenemům (blaNDM) nebo kolistinu (mcr). Pokud infekci způsobí patogen s tímto aparátem, zbývají lékařům minimální nebo žádné možnosti účinné léčby.

intI3 

Typicky vázané ARG: 

blaIMP, blaVIM (karbapenemázy) 
aac, aad (aminoglykosidy) 
sul1, dfrA (sulfonamidy, trimethoprim) 

Gen pro integrázu 3. třídy 

Katalyzuje záchyt a řazení genových kaset za sebou. Je hlavním nástrojem pro vznik a akumulaci multirezistence (MDR).

Znečištěné vodní ekosystémy, kal z ČOV 

Integrony 3. třídy (méně běžné než tř. 1, ale klinicky velmi nebezpečné) fungují v prostředí jako "sběrače" na geny rezistence. V místech s vysokým tlakem selekce (odpadní vody s rezidui léčiv) hromadí různé ARG do jednoho "balíku". 

Vznik panrezistentních mikroorganismů (MDR/XDR) 

Díky intI3 může patogen naráz získat rezistenci proti 5–10 různým třídám antibiotik. Při nákaze pacienta na JIP je taková infekce prakticky neléčitelná standardními postupy, což vede k vysoké úmrtnosti. 

Obrázek:  Molekulární architektura složeného transposonu (composite transposon)

  • Gen rezistence vůči antibiotikům (ARG) je oboustranně lemován inzerčními sekvencemi (IS elementy, např. IS1133, IS1247), které obsahují invertovaná opakování (inverted repeats = IR… „rozpoznávací značky pro enzym transposázu“) a kódují enzym transposázu. IS element slouží jako molekulární přenašeč i transkripční zesilovač – vnitřní promotory v IS prvcích výrazně zvyšují expresi vloženého genu rezistence v hostitelské buňce.

Obrázek:  Horizontální přenos genů rezistence zprostředkovaný transposázou a konjugativním plazmidem

  • Enzym transposáza (kódovaný genem tnpA) zprostředkovává přeskok genů rezistence (např. blaNDM či mcr) z chromozomu na mobilní konjugativní plazmid bez ohledu na příbuznost bakterií (recA-independent). Tento plazmid je následně přenesen přes pohlavní pilus (konjugace) do jiné bakteriální buňky, což umožňuje rychlé šíření rezistence napříč různými druhy a rodovými liniemi.

Obrázek:  Struktura integronu 3. třídy a mechanismus akumulace genových kaset 

  • Integráza IntI3 (kódovaná genem intI3) rozpoznává specifická rekombinační místa (attI a attC) a katalyzuje site-specifickou vsuvku volných genových kaset. Tento aparát funguje v prostředí jako „lapač genů“, který řadí jednotlivé geny rezistence (např. pro laktamy, aminoglykosidy a sulfonamidy) za společný promotor (Pc), čímž vytváří multirezistentní (MDR) genové bloky.