Pozice: Vědecký pracovník (V4) po dobu trvání projektu
Anotace: Konvenční metody stanovení mikrobiálního znečištění v systému zásobování pitnou vodou jsou založeny převážně na kultivačních metodách s odezvou v řádu desítek hodin (18 až 24 hod), což omezuje schopnost provozovatelů včas reagovat na změny v kvalitě distribuované vody a komplikuje kontrolu při pravidelné údržbě nebo proplachu po haváriích. Pro zvýšení akceschopnosti provozovatelů a snížení rizik ohrožení lidského zdraví, technologických problémů nebo havárií distribučních sítí pitných vod je proto žádoucí vyvinout a popsat analytické metody se zkrácenou odezvou v řádu nejvýše nižších jednotek hodin. Další výzvou je zavést dostatečně citlivou detekci konkrétně pro enterické viry, jelikož i desítky virionů mohou způsobit infekci. Novou výzvou pro vodárenskou infrastrukturu je antibiotická rezistence, kde řada klíčových dat ohledně osudu příslušných genů zcela chybí.
Prvním cílem projektu je vyvinout vysoce citlivou a rychlou detekci patogenních agens ve vodách (vč. norovirů, rotavirů) pomocí inovativního zakoncentrování a RT-PCR, průtokové cytometrie a optimalizované kultivace pro účinnou prevenci a řešení havárií úpraven a distribučních sítí pitné vody (př. Dejvice 2015, Polička 2019). Druhým cílem je zmapovat na vodárnách upravujících povrchovou vodu odstraňování či amplifikaci DNA nesoucí geny antibiotické rezistence, a to včetně opomíjené volně plovoucí extracelulární DNA a fágů, a identifikovat kombinaci a optimální nastavení procesů technologie (i distribuce), což ve výsledku zredukuje obsah genů antibiotické rezistence v pitné vodě.
Student bude veden seniorními pracovníky Ústavu technologie vody a prostředí a Ústavu biochemie a mikrobiologie s expertízou na úpravu a distribuci vod, mikrobiologii pitné vody a detekci virů a antibiotické rezistence. Klíčovou roli pro testování v reálných podmínkách mají v projektu Pražské vodovody a kanalizace.
Identifikace projektu: SS07020223 NEGEV; Metody nové generace pro vysoce citlivou a rychlou detekci fekálního znečištění a antibiotické rezistence pro podporu oběhového vodního hospodářství
Poskytovatel: TAČR – Prostředí pro život
Doba trvání projektu: 2 roky
Finanční podmínky: Pozice financovaná projektem pokrývá měsíční hrubou mzdu 32 800 Kč. a projekt trvá do konce června 2026. Po tomto datu se snažíme zajistit další financování.
V případě nástupu do doktorského programu navíc obdrží student stipendium ve výši minimálně 7 700 Kč, které se u naprosté většiny studentů navyšuje při vykázání pedagogických aktivit (3 500 Kč) a při zapojení do vědecké činnosti (2 900 Kč). stipendium se může dále navyšovat na základě vědeckých výsledků. Stipendium bude vypláceno po dobu 48 měsíců.
Požadavky:
- Titul Ing. nebo Mgr. v oboru Chemické/Environmentální inženýrství, Mikrobiologie nebo Bioinformatika. Přihlásit se mohou i kandidáti, kteří s vysokou pravděpodobností dosáhnou titul nejpozději v červnu 2024.
- Prokazatelné znalosti a zájem o biologické procesy a biotechnologie.
- Samostatnost, motivace, proaktivita, otevřenost komunikaci a spolupráci v multioborovém týmu
- Schopnost vědecké práce v kombinaci s praktičností
- Zkušenost s laboratorní prací doložená absolvováním laboratorních kurzů, stážemi nebo jinou předchozí prací.
- Výborná úroveň mluvené i psané angličtiny